Oxalobacter formigenes เป็นแบคทีเรียแกรมลบที่ย่อยสลายออกซาเลตแบบไม่ใช้ออกซิเจนซึ่งแยกได้ครั้งแรกจากทางเดินอาหารของแกะใน พ.ศ. 2528 ปัจจุบันพบแบคทีเรียชนิดนี้อาศัยอยู่ในลำไส้ใหญ่ของสัตว์มีกระดูกสันหลังหลายชนิด รวมทั้งมนุษย์ และยังแยกได้จากตะกอนในแหล่งน้ำจืดอีกด้วย แบคทีเรียชนิดนี้จะแปรรูปออกซาเลตให้เป็นด้วยกระบวนการ ซึ่งอาศัยเอนไซม์ (oxalyl-CoA decarboxylase) นี้เป็นกระบวนการผลิตพลังงานให้แบคทีเรียเอง
Oxalobacter formigenes | |
---|---|
การจำแนกชั้นทางวิทยาศาสตร์ | |
โดเมน: | แบคทีเรีย Bacteria |
ไฟลัม: | Proteobacteria |
ชั้น: | Betaproteobacteria |
อันดับ: | Burkholderiales |
วงศ์: | Oxalobacteraceae |
สกุล: | Oxalobacter Allison et al, 1985 |
สปีชีส์: | Oxalobacter formigenes |
ชื่อทวินาม | |
Oxalobacter formigenes Allison et al, 1985 | |
Oxalobacter formigenes OxBT |
ยาปฏิชีวนะกลุ่มควิโนโลนแบบขอบเขตในการออกฤทธิ์กว้างสามารถฆ่าเชื้อ O. formigenes ได้ หากทางเดินอาหารของบุคคลไม่มีแบคทีเรียชนิดนี้ จะไม่มีแหล่งหลักของเอนไซม์ออกซาลีล-โคเอ ดีคาร์บอกซิเลส ทางเดินอาหารก็จะไม่สามารถย่อยออกซาเลตจากอาหารได้ หลังจากร่างกายย่อยสลายออกซาเลตบางส่วนตามการควบคุมของวิตามินบี 6 แล้ว ออกซาเลตจะถูกขับออกทางไต ซึ่งจะตกตะกอนจนกลายเป็นนิ่วในไตจากแคลเซียมออกซาเลตOxalobacter formigenes สามารถป้องกันนิ่วในไตได้โดยการย่อยออกซาเลต
บทบาทและการปรากฏพบ O. formigenes ในลำไส้ของมนุษย์เป็นหัวข้อการวิจัยที่ได้รับความสนใจดำเนินการ
จีโนม
2.41–2.47 Mb |
จีโนมของ O. formigenes ได้รับการจัดลำดับโดยนักวิจัยอย่างน้อยสามคณะ โดยมีปริมาณ G+C อยู่ที่ร้อยละ 49.6
อนุกรมวิธาน
จากสัดส่วนกรดไขมัน การหาลำดับเบสองค์ประกอบ 16S ของไรโบโซมอล อาร์เอ็นเอ (16S rRNA) และดีเอ็นเอตรวจสอบ (DNA probe) ที่จำเพาะต่อยีน oxc (ออกซาลิล-โคเอ ดีคาร์บอกซิเลส) และ frc (ฟอร์มิล-โคเอ ทรานสเฟอเรส) O. formigenes ได้ถูกแบ่งออกเป็น 2 กลุ่ม กลุ่ม 1 มีความหลากหลายน้อยกว่าและเจริญเติบโตได้ดีกว่ากลุ่ม 2 จนถึงปัจจุบัน การวิจัยส่วนใหญ่เน้นที่สายพันธุ์กลุ่ม 1 เนื่องจากเจริญเติบโตได้ง่าย
การวิเคราะห์ด้วยดีเอ็นเอตรวจสอบ แสดงให้เห็นว่ากลุ่มที่ 2 อาจแบ่งออกได้อีกเป็นสองกลุ่มย่อย การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดเผยให้เห็นว่าหน่วยอนุกรมวิธานดั้งเดิมของ O. formigenes สามารถแบ่งออกได้เป็นสปีชีส์เพิ่มเติมอีกสามสปีชีส์ ได้แก่ , และ
เมแทบอลิซึม
O. formigenes ใช้ออกซาเลตเป็นแหล่งคาร์บอนหลัก ออกซาเลตถูกดูดซึมผ่านโปรตีน ออกซาเลต:ฟอร์เมต แอนติพอร์ตเตอร์ (oxalate:formate antiporter, OxlT) ในสัดส่วน 1:1 จากนั้นออกซาเลตที่นำเข้าจะถูกแปลงเป็นออกซาลิล-โคเอ ผ่านเอนไซม์ฟอร์มิล-โคเอ ทรานสเฟอเรส (formyl-CoA transferase, frc) ซึ่งออกซาลิล-โคเอ จะถูกกำจัดโดยใช้ H+ ผ่านเอนไซม์ออกซาลิล-โคเอ ดีคาร์บอกซิเลส (oxc) ปล่อย CO2 และสร้างฟอร์มิล-โคเอ ซึ่งใช้สำหรับปฏิกิริยา frc โดยรวมแล้ว ฟอร์เมตและ CO2 ประมาณ 1 โมล ถูกผลิตขึ้นต่อออกซาเลตที่บริโภคไป 1 โมล 3H+ ถูกนำเข้ามาผ่านเอนไซม์กลุ่มเอทีเพส (ATPase) เพื่อให้ H+ สำหรับปฏิกิริยา
การสร้างชีวมวลเซลล์
ชีวมวลใน O. formigenes เกิดขึ้นจากการบริโภคออกซาเลตเป็นหลักผ่านการเผาผลาญออกซาลิล-โคเอ ในวิถีเมแทบอลิซึมของและก็ถูกใช้สำหรับสร้างชีวมวลเซลล์ แต่ใช้ในปริมาณที่น้อยกว่าออกซาเลต
การเจริญในการเพาะเลี้ยง
O. formigenes ถูกแยกในออกซาเลตที่มีอาหารเลี้ยงเชื้อแบบไม่ใช้ออกซิเจน ปัจจุบัน O. formigenes ถูกเพาะในหลอดทดลองปิดผนึกสูงแบบไม่ใช้ออกซิเจน (Hungate tube) โดยใช้อาหารเลี้ยงเชื้อที่มีคาร์บอนไดออกไซด์-ไบคาร์บอเนตบัฟเฟอร์และออกซาเลต การเจริญเติบโตที่เหมาะสมที่สุดจะเกิดขึ้นที่ค่า pH ระหว่าง 6 ถึง 7 ออกซาเลตใช้ที่ 20 มิลลิโมลาร์ สำหรับการฟื้นคืนสภาพจากการแช่แข็งและการบำรุงรักษาโดยทั่วไป แต่สามารถเพิ่มความเข้มข้นเป็น 100 เพื่อเพิ่มความหนาแน่นของเซลล์ได้ ในขณะที่ออกซาเลตเป็นแหล่งคาร์บอนหลัก และสารสกัดจากยีสต์ในปริมาณเล็กน้อยก็ช่วยสนับสนุนการเจริญเติบโตได้O. formigenes สามารถเข้าสู่ระยะคงที่ได้ในเวลาประมาณ 24–48 ชั่วโมง แต่บางครั้งอาจล่าช้าถึง 72 ชั่วโมง
อาหารเพาะเลี้ยงแบบไม่ใช้ออกซิเจนที่มีส่วนผสมซับซ้อน (เช่น ) ไม่สามารถสนับสนุนการเติบโตของ O. formigenes ได้ เว้นแต่จะเสริมด้วยออกซาเลต ดังนั้นจึงสามารถใช้อาหารเสริมเหล่านี้เพื่อประเมินความบริสุทธิ์ของเชื้อ O. formigenes ได้
การดื้อยาและความไวต่อยาปฏิชีวนะ
เนื่องจาก O. formigenes เป็นแบคทีเรียที่ต้องการการเพาะเลี้ยงที่พิถีพิถัน วิธีการดั้งเดิมในการทดสอบความไวต่อยาปฏิชีวนะจึงไม่เพียงพอ แบคทีเรียจะได้รับการเพาะเลี้ยงในสภาพที่มียาปฏิชีวนะและคัดกรองความมีชีวิตโดยใช้วุ้นออกซาเลตแบบแอนแอโรบิกทึบแสง วิธีนี้แสดงให้เห็นว่า O. formigenes ดื้อต่อกรดนาลิดิซิก แอมพิซิลลิน อะม็อกซีซิลลิน สเตรปโตมัยซิน และ นอกจากนี้ยังพบว่า O. formigenes ไวต่อซิโปรฟลอกซาซิน เจนตามัยซิน และ
อุบัติการณ์ในลำไส้ของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม
พบ O. formigenes ในระบบทางเดินอาหารของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมและมักแยกได้จากอุจจาระ นอกจากวิธีการเพาะเชื้อแล้ว ยังสามารถตรวจพบ O. formigenes ได้โดยใช้เทคนิคทางโมเลกุล เช่น และการวิเคราะห์ลำดับเบสเอ็นจีเอส ()
มนุษย์
โดยทั่วไปมนุษย์ไม่ได้เกิดมาพร้อมกับเชื้อ O. formigenes และเชื้อจะเข้ามาอาศัยในลำไส้มนุษย์เมื่อทารกเริ่มคลานไปรอบ ๆ ในวัยผู้ใหญ่ ความถี่ที่พบของเชื้อ O. formigenes ในจุลินทรีย์ในลำไส้จะแตกต่างกันไปในแต่ละกลุ่มประชากร ในภาคเหนือของอินเดีย เชื้อ O. formigenes พบได้ประมาณร้อยละ 65 ของประชากร ในเกาหลีใต้และญี่ปุ่น เชื้อ O. formigenes พบได้ประมาณร้อยละ 75 ของประชากร ในสหรัฐอเมริกา เชื้อ O. formigenes พบได้เพียงประมาณร้อยละ 30 ของประชากร ประชากรที่ไม่ได้ปฏิบัติตามการแพทย์สมัยใหม่หรือใช้ชีวิตตามวัฒนธรรมตะวันตก มักจะพบเชื้อ O. formigenes มากขึ้น ซึ่งอาจหมายความว่าวิถีการปฏิบัตินี้ส่งผลต่อการเจริญเป็นกลุ่มในลำไส้ของเชื้อ O. formigenes
สัตว์เคี้ยวเอื้อง
แนวคิดที่ว่าสัตว์เคี้ยวเอื้องมีแบคทีเรียที่ย่อยสลายออกซาเลตอาศัยอยู่ เกิดจากการสังเกตพบว่าแกะที่กินพืชที่มีออกซาเลตสูง (เช่น Halogeton glomeratus) กินพืชชนิดนี้เข้าไปเป็นจำนวนมากและตายโดยพิษต่อไตจากออกซาเลต อย่างไรก็ตาม การทำให้แกะปรับตัวให้ชินกับการบริโภคออกซาเลตในปริมาณสูงอย่างช้า ๆ จะทำให้แกะสามารถรอดชีวิตจากการบริโภคพืชที่มีออกซาเลตสูงในปริมาณมากได้ ส่งผลให้มีการเสนอว่าแบคทีเรียประจำถิ่นที่ย่อยสลายออกซาเลตจะได้รับการเสริมประสิทธิภาพโดยการค่อย ๆ ให้อาหารที่มีออกซาเลตสูง ซึ่งจะช่วยปกป้องแกะจากความเสียหายของไตที่เกิดจากออกซาเลต ในปี พ.ศ. 2523 แบคทีเรียที่ย่อยสลายออกซาเลตตัวแรกถูกแยกออกจากกระเพาะผ้าขี้ริ้วของแกะ และต่อมาได้มีการตั้งชื่อแบคทีเรียชนิดนี้ว่า Oxalobacter formigenes
บทบาทที่เป็นไปได้ในโรคนิ่วในไต
มีการศึกษาวิจัย O. formigenes เพื่อดูบทบาทในการบรรเทาที่เกิดจากแคลเซียมออกซาเลต เนื่องจาก O. formigenes เผาผลาญออกซาเลตเพื่อใช้เป็นแหล่งคาร์บอนหลัก
การย่อยสลายออกซาเลต
จากการทดลองในหลอดทดลองพบว่า O. formigenes เป็นแบคทีเรียที่กินออกซาเลตโดยเฉพาะ ซึ่งสามารถย่อยสลายออกซาเลตได้อย่างมีประสิทธิภาพมากกว่าแบคทีเรียที่กินออกซาเลตทั่วไปชนิดอื่น ๆ การวิจัยเบื้องต้นชี้ให้เห็นถึงการสูญเสียแบคทีเรียที่ย่อยสลายออกซาเลต เช่น O. formigenes หลังจากการใช้ยาปฏิชีวนะ เป็นสาเหตุหลักที่ทำให้เกิดโรคนิ่วในไตจากแคลเซียมออกซาเลต การเจริญเป็นกลุ่มในลำไส้ของ O. formigenes พบว่าส่งผลให้ปริมาณออกซาเลตในปัสสาวะลดลง และความถี่ของการเกิดนิ่วในไตลดลง
จากงานศึกษาวิจัยขนาดเล็ก การเสริมด้วย O. formigenes HC-1 (สายพันธุ์ในมนุษย์) ทางปากร่วมกับการให้ออกซาเลตขนาดเริ่มต้น ส่งผลให้การขับออกซาเลตลดลงในช่วง 6 ชั่วโมงทันทีหลังจากกิน อย่างไรก็ตาม การทดลองทางคลินิกไม่ประสบความสำเร็จในการสร้างกลุ่มเจริญของ O. formigenes และการลดความเข้มข้นของออกซาเลตในปัสสาวะและพลาสมา
งานวิจัยล่าสุดที่ใช้การวิเคราะห์ลำดับเบสเอ็นจีเอสพบว่า O. formigenes เข้าไปเจริญเป็นกลุ่มในลำไส้ของกลุ่มควบคุมที่มีการก่อตัวของนิ่วในไตจากแคลเซียมออกซาเลตและกลุ่มควบคุมที่ไม่มีการก่อตัวของนิ่ว การสังเกตนี้ทำให้เกิดแนวคิดว่า O. formigenes อาจไม่ใช่ชนิดพันธุ์เดียวที่ควบคุมการย่อยสลายออกซาเลตของจุลินทรีย์ในลำไส้ แต่เป็นส่วนหนึ่งของเครือข่ายแบคทีเรียที่เกิดร่วมกันซึ่งควบคุมการย่อยสลายออกซาเลตร่วมกัน
สารเร่งการคัดหลั่งที่ส่งเสริมภาวะ Oxalate dumping ในลำไส้
มีการเสนอว่า O. formigenes สร้างที่สามารถกระตุ้นการขนส่งออกซาเลตใน แม้ว่าจะมีการแสดงการหลั่งออกซาเลตในเซลล์เยื่อบุผนังลำไส้ในของมนุษย์และแบบจำลองสัตว์ฟันแทะ แต่ยังไม่ได้รับการยืนยันในมนุษย์ โมเลกุลออกฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีศักยภาพได้รับการระบุและทดสอบในแบบจำลองสัตว์
อ้างอิง
- Allison MJ, Dawson KA, Mayberry WR, Foss JG (กุมภาพันธ์ 1985). "Oxalobacter formigenes gen. nov., sp. nov.: oxalate-degrading anaerobes that inhabit the gastrointestinal tract". Archives of Microbiology. 141 (1): 1–7. Bibcode:1985ArMic.141....1A. doi:10.1007/BF00446731. PMID 3994481. S2CID 10709172.
- Daniel SL, Moradi L, Paiste H, Wood KD, Assimos DG, Holmes RP, และคณะ (สิงหาคม 2021). Pettinari JM (บ.ก.). "Forty Years of Oxalobacter formigenes, a Gutsy Oxalate-Degrading Specialist". Applied and Environmental Microbiology. 87 (18): e0054421. Bibcode:2021ApEnM..87E.544D. doi:10.1128/AEM.00544-21. PMC 8388816. PMID 34190610.
- Unden G (2013). "Energy Transduction in Anaerobic Bacteria". Encyclopedia of Biological Chemistry. pp. 204–209. doi:10.1016/B978-0-12-378630-2.00282-6. ISBN .
- H. A. Holt; D. A. Lewis; L. O. White; S. Y. Bastable; D. S. Reeves (เมษายน 1986). "Effect of oral ciprofloxacin on the faecal flora of healthy volunteers". European Journal of Clinical Microbiology. Springer Nature. 5: 201–205. 1435-4373.
- Troxel SA, Sidhu H, Kaul P, Low RK (เมษายน 2003). "Intestinal Oxalobacter formigenes colonization in calcium oxalate stone formers and its relation to urinary oxalate". Journal of Endourology. 17 (3): 173–176. doi:10.1089/089277903321618743. PMID 12803990.
- Tunuguntla HS (2001). "Can the recurrence of oxalate stones be prevented? Role of Oxalobacter formigenes in stone recurrence". Journal of Urology. 165: S246.
- Pearle MS, Goldfarb DS, Assimos DG, Curhan G, Denu-Ciocca CJ, Matlaga BR, และคณะ (สิงหาคม 2014). "Medical management of kidney stones: AUA guideline". The Journal of Urology. 192 (2): 316–324. doi:10.1016/j.juro.2014.05.006. PMID 24857648. S2CID 206623478.
- Siener R, Bangen U, Sidhu H, Hönow R, von Unruh G, Hesse A (มิถุนายน 2013). "The role of Oxalobacter formigenes colonization in calcium oxalate stone disease". Kidney International. 83 (6): 1144–1149. doi:10.1038/ki.2013.104. PMID 23536130.
- Sun NY, Gao Y, Yu HJ (October 2019). Stewart FJ (บ.ก.). "Genome Sequence of Oxalobacter formigenes Strain SSYG-15". Microbiology Resource Announcements. 8 (42): e01059–19. doi:10.1128/MRA.01059-19. PMC 6797538. PMID 31624173.
- Hatch M, Allison MJ, Yu F, Farmerie W (กรกฎาคม 2017). "Genome Sequence of Oxalobacter formigenes Strain OXCC13". Genome Announcements. 5 (28): e00534–17. doi:10.1128/genomeA.00534-17. PMC 5511905. PMID 28705966.
- Hatch M, Allison MJ, Yu F, Farmerie W (กรกฎาคม 2017). "Genome Sequence of Oxalobacter formigenes Strain HC-1". Genome Announcements. 5 (27): e00533–17. doi:10.1128/genomeA.00533-17. PMC 5502849. PMID 28684568.
- Chmiel JA, Carr C, Stuivenberg GA, Venema R, Chanyi RM, Al KF, และคณะ (21 ธันวาคม 2022). "New perspectives on an old grouping: The genomic and phenotypic variability of Oxalobacter formigenes and the implications for calcium oxalate stone prevention". Frontiers in Microbiology. 13: 1011102. doi:10.3389/fmicb.2022.1011102. PMC 9812493. PMID 36620050.
- Jensen NS, Allison MJ (1994). Studies on the diversity among anaerobic oxalate-degrading bacteria now in the species Oxalobacter formigenes, abstr. I-12. 94th General Meeting of the American Society for Microbiology 1994. Washington, D.C., USA: American Society for Microbiology. p. 255.
- Sidhu H, Allison M, Peck AB (กุมภาพันธ์ 1997). "Identification and classification of Oxalobacter formigenes strains by using oligonucleotide probes and primers". Journal of Clinical Microbiology. 35 (2): 350–353. doi:10.1128/jcm.35.2.350-353.1997. PMC 229578. PMID 9003594.
- Garrity GM, Bell JA, Lilburn T (2005). "Class II. Betaproteobacteria class. nov.". ใน Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT (บ.ก.). Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology (ภาษาอังกฤษ). Boston, MA: Springer US. pp. 575–922. doi:10.1007/978-0-387-29298-4_2. ISBN . สืบค้นเมื่อ 10 พฤศจิกายน 2022.
- Anantharam, V; Allison, M J; Maloney, P C (1989). "Oxalate:formate exchange". Journal of Biological Chemistry (ภาษาอังกฤษ). 264 (13): 7244–7250. doi:10.1016/S0021-9258(18)83227-6.
- Dawson KA, Allison MJ, Hartman PA (ตุลาคม 1980). "Isolation and some characteristics of anaerobic oxalate-degrading bacteria from the rumen". Applied and Environmental Microbiology. 40 (4): 833–839. Bibcode:1980ApEnM..40..833D. doi:10.1128/aem.40.4.833-839.1980. PMC 291667. PMID 7425628.
- Kuhner, C H; Hartman, P A; Allison, M J (1996). "Generation of a proton motive force by the anaerobic oxalate-degrading bacterium Oxalobacter formigenes". Applied and Environmental Microbiology (ภาษาอังกฤษ). 62 (7): 2494–2500. Bibcode:1996ApEnM..62.2494K. doi:10.1128/aem.62.7.2494-2500.1996. ISSN 0099-2240. PMC 168031. PMID 8779588.
- Cornick, N. A.; Allison, M. J. (1996). "Assimilation of oxalate, acetate, and CO 2 by Oxalobacter formigenes". Canadian Journal of Microbiology (ภาษาอังกฤษ). 42 (11): 1081–1086. doi:10.1139/m96-138. ISSN 0008-4166. PMID 8941983.
- Cornick, N A; Allison, M J (1996). "Anabolic Incorporation of Oxalate by Oxalobacter formigenes". Applied and Environmental Microbiology (ภาษาอังกฤษ). 62 (8): 3011–3013. Bibcode:1996ApEnM..62.3011C. doi:10.1128/aem.62.8.3011-3013.1996. ISSN 0099-2240. PMC 1388924. PMID 16535386.
- Duncan SH, Richardson AJ, Kaul P, Holmes RP, Allison MJ, Stewart CS (สิงหาคม 2002). "Oxalobacter formigenes and its potential role in human health". Applied and Environmental Microbiology. 68 (8): 3841–3847. Bibcode:2002ApEnM..68.3841D. doi:10.1128/AEM.68.8.3841-3847.2002. PMC 124017. PMID 12147479.
- Lange JN, Wood KD, Wong H, Otto R, Mufarrij PW, Knight J, และคณะ (มิถุนายน 2012). "Sensitivity of human strains of Oxalobacter formigenes to commonly prescribed antibiotics". Urology. 79 (6): 1286–1289. doi:10.1016/j.urology.2011.11.017. PMC 3569510. PMID 22656407.
- Sidhu H, Enatska L, Ogden S, Williams WN, Allison MJ, Peck AB (มิถุนายน 1997). "Evaluating Children in the Ukraine for Colonization With the Intestinal Bacterium Oxalobacter formigenes, Using a Polymerase Chain Reaction-based Detection System". Molecular Diagnosis. 2 (2): 89–97. doi:10.1016/S1084-8592(97)80015-X. PMID 10462596.
- Kumar R, Mukherjee M, Bhandari M, Kumar A, Sidhu H, Mittal RD (มีนาคม 2002). "Role of Oxalobacter formigenes in calcium oxalate stone disease: a study from North India". European Urology. 41 (3): 318–322. doi:10.1016/S0302-2838(02)00040-4. PMID 12180235.
- Kwak C, Jeong BC, Kim HK, Kim EC, Chox MS, Kim HH (พฤษภาคม 2003). "Molecular epidemiology of fecal Oxalobacter formigenes in healthy adults living in Seoul, Korea". Journal of Endourology. 17 (4): 239–243. doi:10.1089/089277903765444384. PMID 12816588.
- Kodama T, Mikami K, Akakura K, Takei K, Naya Y, Ueda T, Ito H (กรกฎาคม 2003). "[Detection of Oxalobacter formigenes in human feces and study of related genes in a new oxalate-degrading bacterium]". Hinyokika Kiyo. Acta Urologica Japonica. 49 (7): 371–376. PMID 12968475.
- Barnett C, Nazzal L, Goldfarb DS, Blaser MJ (กุมภาพันธ์ 2016). "The Presence of Oxalobacter formigenes in the Microbiome of Healthy Young Adults". The Journal of Urology. 195 (2): 499–506. doi:10.1016/j.juro.2015.08.070. PMC 4747808. PMID 26292041.
- Kelly JP, Curhan GC, Cave DR, Anderson TE, Kaufman DW (เมษายน 2011). "Factors related to colonization with Oxalobacter formigenes in U.S. adults". Journal of Endourology. 25 (4): 673–679. doi:10.1089/end.2010.0462. PMC 3071521. PMID 21381959.
- PeBenito A, Nazzal L, Wang C, Li H, Jay M, Noya-Alarcon O, และคณะ (มกราคม 2019). "Comparative prevalence of Oxalobacter formigenes in three human populations". Scientific Reports. 9 (1): 574. Bibcode:2019NatSR...9..574P. doi:10.1038/s41598-018-36670-z. PMC 6346043. PMID 30679485.
- Clemente JC, Pehrsson EC, Blaser MJ, Sandhu K, Gao Z, Wang B, และคณะ (เมษายน 2015). "The microbiome of uncontacted Amerindians". Science Advances. 1 (3). Bibcode:2015SciA....1E0183C. doi:10.1126/sciadv.1500183. PMC 4517851. PMID 26229982.
- James LF, Cronin EH (พฤศจิกายน 1974). "Management practices to minimize death losses of sheep grazing Halogeton-infested range". Journal of Range Management. 27 (6): 424–426. doi:10.2307/3896714. :10150/647155. JSTOR 3896714.
- {{Cite journal | vauthors = Allison MJ, Littledike ET, James LF | title = Changes in ruminal oxalate degradation rates associated with adaptation to oxalate ingestion | journal = Journal of Animal Science | volume = 45 | issue = 5 | pages = 1173–1179 | date = November 1977 | pmid = 599103 | doi = 10.2527/jas1977.4551173x | df = dmy-all}
- Daniel SL, Cook HM, Hartman PA, Allison MJ (สิงหาคม 1989). "Enumeration of anaerobic oxalate-degrading bacteria in the ruminal contents of sheep". FEMS Microbiology Letters (ภาษาอังกฤษ). 62 (5): 329–334. doi:10.1111/j.1574-6968.1989.tb03387.x.
- Federici F, Vitali B, Gotti R, Pasca MR, Gobbi S, Peck AB, Brigidi P (กันยายน 2004). "Characterization and heterologous expression of the oxalyl coenzyme A decarboxylase gene from Bifidobacterium lactis". Applied and Environmental Microbiology. 70 (9): 5066–5073. Bibcode:2004ApEnM..70.5066F. doi:10.1128/AEM.70.9.5066-5073.2004. PMC 520889. PMID 15345383.
- Sidhu H, Hoppe B, Hesse A, Tenbrock K, Brömme S, Rietschel E, Peck AB (กันยายน 1998). "Absence of Oxalobacter formigenes in cystic fibrosis patients: a risk factor for hyperoxaluria". Lancet. 352 (9133): 1026–1029. doi:10.1016/S0140-6736(98)03038-4. PMID 9759746. S2CID 25936201.
- Mittal RD, Kumar R, Bid HK, Mittal B (มกราคม 2005). "Effect of antibiotics on Oxalobacter formigenes colonization of human gastrointestinal tract". Journal of Endourology. 19 (1): 102–106. doi:10.1089/end.2005.19.102. PMID 15735393.
- Kaufman DW, Kelly JP, Curhan GC, Anderson TE, Dretler SP, Preminger GM, Cave DR (มิถุนายน 2008). "Oxalobacter formigenes may reduce the risk of calcium oxalate kidney stones". Journal of the American Society of Nephrology. 19 (6): 1197–1203. doi:10.1681/ASN.2007101058. PMC 2396938. PMID 18322162.
- Hoppe B, Groothoff JW, Hulton SA, Cochat P, Niaudet P, Kemper MJ, และคณะ (พฤศจิกายน 2011). "Efficacy and safety of Oxalobacter formigenes to reduce urinary oxalate in primary hyperoxaluria". Nephrology, Dialysis, Transplantation. 26 (11): 3609–3615. doi:10.1093/ndt/gfr107. PMID 21460356.
- Hoppe B, Niaudet P, Salomon R, Harambat J, Hulton SA, Van't Hoff W, และคณะ (พฤษภาคม 2017). "A randomised Phase I/II trial to evaluate the efficacy and safety of orally administered Oxalobacter formigenes to treat primary hyperoxaluria". Pediatric Nephrology. 32 (5): 781–790. doi:10.1007/s00467-016-3553-8. PMID 27924398. S2CID 52271121.
- Milliner D, Hoppe B, Groothoff J (สิงหาคม 2018). "A randomised Phase II/III study to evaluate the efficacy and safety of orally administered Oxalobacter formigenes to treat primary hyperoxaluria". Urolithiasis. 46 (4): 313–323. doi:10.1007/s00240-017-0998-6. PMC 6061479. PMID 28718073.
- Tang R, Jiang Y, Tan A, Ye J, Xian X, Xie Y, และคณะ (พฤศจิกายน 2018). "16S rRNA gene sequencing reveals altered composition of gut microbiota in individuals with kidney stones". Urolithiasis. 46 (6): 503–514. doi:10.1007/s00240-018-1037-y. PMID 29353409. S2CID 11340007.
- Ticinesi A, Milani C, Guerra A, Allegri F, Lauretani F, Nouvenne A, และคณะ (ธันวาคม 2018). "Understanding the gut-kidney axis in nephrolithiasis: an analysis of the gut microbiota composition and functionality of stone formers". Gut. 67 (12): 2097–2106. doi:10.1136/gutjnl-2017-315734. PMID 29705728. S2CID 14055215.
- Ticinesi A, Nouvenne A, Meschi T (กรกฎาคม 2019). "Gut microbiome and kidney stone disease: not just an Oxalobacter story". Kidney International. 96 (1): 25–27. doi:10.1016/j.kint.2019.03.020. PMID 31229040. S2CID 195327195.
- Miller AW, Choy D, Penniston KL, Lange D (กรกฎาคม 2019). "Inhibition of urinary stone disease by a multi-species bacterial network ensures healthy oxalate homeostasis". Kidney International. 96 (1): 180–188. doi:10.1016/j.kint.2019.02.012. PMC 6826259. PMID 31130222.
- Liu M, Koh H, Kurtz ZD, Battaglia T, PeBenito A, Li H, และคณะ (สิงหาคม 2017). "Oxalobacter formigenes-associated host features and microbial community structures examined using the American Gut Project". Microbiome. 5 (1): 108. doi:10.1186/s40168-017-0316-0. PMC 5571629. PMID 28841836.
- Arvans D, Jung YC, Antonopoulos D, Koval J, Granja I, Bashir M, และคณะ (มีนาคม 2017). "Oxalobacter formigenes-Derived Bioactive Factors Stimulate Oxalate Transport by Intestinal Epithelial Cells". Journal of the American Society of Nephrology. 28 (3): 876–887. doi:10.1681/ASN.2016020132. PMC 5328155. PMID 27738124.
- Hatch M, Cornelius J, Allison M, Sidhu H, Peck A, Freel RW (กุมภาพันธ์ 2006). "Oxalobacter sp. reduces urinary oxalate excretion by promoting enteric oxalate secretion". Kidney International. 69 (4): 691–698. doi:10.1038/sj.ki.5000162. PMID 16518326.
- Arvans D, Chang C, Alshaikh A, Tesar C, Babnigg G, Wolfgeher D, และคณะ (กรกฎาคม 2023). "Sel1-like proteins and peptides are the major Oxalobacter formigenes-derived factors stimulating oxalate transport by human intestinal epithelial cells". American Journal of Physiology. Cell Physiology. 325 (1): C344–C361. doi:10.1152/ajpcell.00466.2021. PMC 10393326. PMID 37125773.
wikipedia, แบบไทย, วิกิพีเดีย, วิกิ หนังสือ, หนังสือ, ห้องสมุด, บทความ, อ่าน, ดาวน์โหลด, ฟรี, ดาวน์โหลดฟรี, mp3, วิดีโอ, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, รูปภาพ, เพลง, เพลง, หนัง, หนังสือ, เกม, เกม, มือถือ, โทรศัพท์, Android, iOS, Apple, โทรศัพท์โมบิล, Samsung, iPhone, Xiomi, Xiaomi, Redmi, Honor, Oppo, Nokia, Sonya, MI, PC, พีซี, web, เว็บ, คอมพิวเตอร์
Oxalobacter formigenes epnaebkhthieriyaekrmlbthiyxyslayxxksaeltaebbimichxxksiecnsungaeykidkhrngaerkcakthangedinxaharkhxngaekain ph s 2528 pccubnphbaebkhthieriychnidnixasyxyuinlaisihykhxngstwmikraduksnhlnghlaychnid rwmthngmnusy aelayngaeykidcaktakxninaehlngnacudxikdwy aebkhthieriychnidnicaaeprrupxxksaeltihepndwykrabwnkar sungxasyexnism oxalyl CoA decarboxylase niepnkrabwnkarphlitphlngnganihaebkhthieriyexngOxalobacter formigeneskarcaaenkchnthangwithyasastrodemn aebkhthieriy Bacteriaiflm Proteobacteriachn Betaproteobacteriaxndb Burkholderialeswngs Oxalobacteraceaeskul Oxalobacter Allison et al 1985spichis Oxalobacter formigeneschuxthwinamOxalobacter formigenes Allison et al 1985Oxalobacter formigenes OxBT yaptichiwnaklumkhwionolnaebbkhxbekhtinkarxxkvththikwangsamarthkhaechux O formigenes id hakthangedinxaharkhxngbukhkhlimmiaebkhthieriychnidni caimmiaehlnghlkkhxngexnismxxksalil okhex dikharbxksiels thangedinxaharkcaimsamarthyxyxxksaeltcakxaharid hlngcakrangkayyxyslayxxksaeltbangswntamkarkhwbkhumkhxngwitaminbi 6 aelw xxksaeltcathukkhbxxkthangit sungcatktakxncnklayepnniwinitcakaekhlesiymxxksaeltOxalobacter formigenes samarthpxngknniwinitidodykaryxyxxksaelt bthbathaelakarpraktphb O formigenes inlaiskhxngmnusyepnhwkhxkarwicythiidrbkhwamsnicdaeninkarcionmkhxmuldancionm2 41 2 47 Mb cionmkhxng O formigenes idrbkarcdladbodynkwicyxyangnxysamkhna odymipriman G C xyuthirxyla 49 6xnukrmwithancaksdswnkrdikhmn karhaladbebsxngkhprakxb 16S khxngirobosmxl xarexnex 16S rRNA aeladiexnextrwcsxb DNA probe thicaephaatxyin oxc xxksalil okhex dikharbxksiels aela frc fxrmil okhex thransefxers O formigenes idthukaebngxxkepn 2 klum klum 1 mikhwamhlakhlaynxykwaaelaecriyetibotiddikwaklum 2 cnthungpccubn karwicyswnihyennthisayphnthuklum 1 enuxngcakecriyetibotidngay karwiekhraahdwydiexnextrwcsxb aesdngihehnwaklumthi 2 xacaebngxxkidxikepnsxngklumyxy karcdladbcionmthnghmdephyihehnwahnwyxnukrmwithandngedimkhxng O formigenes samarthaebngxxkidepnspichisephimetimxiksamspichis idaek aelaemaethbxlisumO formigenes ichxxksaeltepnaehlngkharbxnhlk xxksaeltthukdudsumphanoprtin xxksaelt fxremt aexntiphxrtetxr oxalate formate antiporter OxlT insdswn 1 1 caknnxxksaeltthinaekhacathukaeplngepnxxksalil okhex phanexnismfxrmil okhex thransefxers formyl CoA transferase frc sungxxksalil okhex cathukkacdodyich H phanexnismxxksalil okhex dikharbxksiels oxc plxy CO2 aelasrangfxrmil okhex sungichsahrbptikiriya frc odyrwmaelw fxremtaela CO2 praman 1 oml thukphlitkhuntxxxksaeltthibriophkhip 1 oml 3H thuknaekhamaphanexnismklumexthiephs ATPase ephuxih H sahrbptikiriya karsrangchiwmwlesll chiwmwlin O formigenes ekidkhuncakkarbriophkhxxksaeltepnhlkphankarephaphlayxxksalil okhex inwithiemaethbxlisumkhxngaelakthukichsahrbsrangchiwmwlesll aetichinprimanthinxykwaxxksaeltkarecriyinkarephaaeliyngO formigenes thukaeykinxxksaeltthimixahareliyngechuxaebbimichxxksiecn pccubn O formigenes thukephaainhlxdthdlxngpidphnuksungaebbimichxxksiecn Hungate tube odyichxahareliyngechuxthimikharbxnidxxkisd ibkharbxentbfefxraelaxxksaelt karecriyetibotthiehmaasmthisudcaekidkhunthikha pH rahwang 6 thung 7 xxksaeltichthi 20 milliomlar sahrbkarfunkhunsphaphcakkaraechaekhngaelakarbarungrksaodythwip aetsamarthephimkhwamekhmkhnepn 100 ephuxephimkhwamhnaaennkhxngesllid inkhnathixxksaeltepnaehlngkharbxnhlk aelasarskdcakyistinprimanelknxykchwysnbsnunkarecriyetibotidO formigenes samarthekhasurayakhngthiidinewlapraman 24 48 chwomng aetbangkhrngxaclachathung 72 chwomng xaharephaaeliyngaebbimichxxksiecnthimiswnphsmsbsxn echn imsamarthsnbsnunkaretibotkhxng O formigenes id ewnaetcaesrimdwyxxksaelt dngnncungsamarthichxaharesrimehlaniephuxpraeminkhwambrisuththikhxngechux O formigenes idkarduxyaaelakhwamiwtxyaptichiwnaenuxngcak O formigenes epnaebkhthieriythitxngkarkarephaaeliyngthiphithiphithn withikardngediminkarthdsxbkhwamiwtxyaptichiwnacungimephiyngphx aebkhthieriycaidrbkarephaaeliynginsphaphthimiyaptichiwnaaelakhdkrxngkhwammichiwitodyichwunxxksaeltaebbaexnaexorbikthubaesng withiniaesdngihehnwa O formigenes duxtxkrdnalidisik aexmphisillin xamxksisillin setrpotmysin aela nxkcakniyngphbwa O formigenes iwtxsioprflxksasin ecntamysin aelaxubtikarninlaiskhxngstweliynglukdwynmphb O formigenes inrabbthangedinxaharkhxngstweliynglukdwynmaelamkaeykidcakxuccara nxkcakwithikarephaaechuxaelw yngsamarthtrwcphb O formigenes idodyichethkhnikhthangomelkul echn aelakarwiekhraahladbebsexnciexs mnusy odythwipmnusyimidekidmaphrxmkbechux O formigenes aelaechuxcaekhamaxasyinlaismnusyemuxtharkerimkhlaniprxb inwyphuihy khwamthithiphbkhxngechux O formigenes inculinthriyinlaiscaaetktangknipinaetlaklumprachakr inphakhehnuxkhxngxinediy echux O formigenes phbidpramanrxyla 65 khxngprachakr inekahliitaelayipun echux O formigenes phbidpramanrxyla 75 khxngprachakr inshrthxemrika echux O formigenes phbidephiyngpramanrxyla 30 khxngprachakr prachakrthiimidptibtitamkaraephthysmyihmhruxichchiwittamwthnthrrmtawntk mkcaphbechux O formigenes makkhun sungxachmaykhwamwawithikarptibtinisngphltxkarecriyepnkluminlaiskhxngechux O formigenes stwekhiywexuxng aenwkhidthiwastwekhiywexuxngmiaebkhthieriythiyxyslayxxksaeltxasyxyu ekidcakkarsngektphbwaaekathikinphuchthimixxksaeltsung echn Halogeton glomeratus kinphuchchnidniekhaipepncanwnmakaelatayodyphistxitcakxxksaelt xyangirktam karthaihaekaprbtwihchinkbkarbriophkhxxksaeltinprimansungxyangcha cathaihaekasamarthrxdchiwitcakkarbriophkhphuchthimixxksaeltsunginprimanmakid sngphlihmikaresnxwaaebkhthieriypracathinthiyxyslayxxksaeltcaidrbkaresrimprasiththiphaphodykarkhxy ihxaharthimixxksaeltsung sungcachwypkpxngaekacakkhwamesiyhaykhxngitthiekidcakxxksaelt inpi ph s 2523 aebkhthieriythiyxyslayxxksaelttwaerkthukaeykxxkcakkraephaaphakhiriwkhxngaeka aelatxmaidmikartngchuxaebkhthieriychnidniwa Oxalobacter formigenesbthbaththiepnipidinorkhniwinitmikarsuksawicy O formigenes ephuxdubthbathinkarbrrethathiekidcakaekhlesiymxxksaelt enuxngcak O formigenes ephaphlayxxksaeltephuxichepnaehlngkharbxnhlk karyxyslayxxksaelt cakkarthdlxnginhlxdthdlxngphbwa O formigenes epnaebkhthieriythikinxxksaeltodyechphaa sungsamarthyxyslayxxksaeltidxyangmiprasiththiphaphmakkwaaebkhthieriythikinxxksaeltthwipchnidxun karwicyebuxngtnchiihehnthungkarsuyesiyaebkhthieriythiyxyslayxxksaelt echn O formigenes hlngcakkarichyaptichiwna epnsaehtuhlkthithaihekidorkhniwinitcakaekhlesiymxxksaelt karecriyepnkluminlaiskhxng O formigenes phbwasngphlihprimanxxksaeltinpssawaldlng aelakhwamthikhxngkarekidniwinitldlng cakngansuksawicykhnadelk karesrimdwy O formigenes HC 1 sayphnthuinmnusy thangpakrwmkbkarihxxksaeltkhnaderimtn sngphlihkarkhbxxksaeltldlnginchwng 6 chwomngthnthihlngcakkin xyangirktam karthdlxngthangkhlinikimprasbkhwamsaercinkarsrangklumecriykhxng O formigenes aelakarldkhwamekhmkhnkhxngxxksaeltinpssawaaelaphlasma nganwicylasudthiichkarwiekhraahladbebsexnciexsphbwa O formigenes ekhaipecriyepnkluminlaiskhxngklumkhwbkhumthimikarkxtwkhxngniwinitcakaekhlesiymxxksaeltaelaklumkhwbkhumthiimmikarkxtwkhxngniw karsngektnithaihekidaenwkhidwa O formigenes xacimichchnidphnthuediywthikhwbkhumkaryxyslayxxksaeltkhxngculinthriyinlais aetepnswnhnungkhxngekhruxkhayaebkhthieriythiekidrwmknsungkhwbkhumkaryxyslayxxksaeltrwmkn sarerngkarkhdhlngthisngesrimphawa Oxalate dumping inlais mikaresnxwa O formigenes srangthisamarthkratunkarkhnsngxxksaeltin aemwacamikaraesdngkarhlngxxksaeltineslleyuxbuphnnglaisinkhxngmnusyaelaaebbcalxngstwfnaetha aetyngimidrbkaryunyninmnusy omelkulxxkvththithangchiwphaphthimiskyphaphidrbkarrabuaelathdsxbinaebbcalxngstwxangxingAllison MJ Dawson KA Mayberry WR Foss JG kumphaphnth 1985 Oxalobacter formigenes gen nov sp nov oxalate degrading anaerobes that inhabit the gastrointestinal tract Archives of Microbiology 141 1 1 7 Bibcode 1985ArMic 141 1A doi 10 1007 BF00446731 PMID 3994481 S2CID 10709172 Daniel SL Moradi L Paiste H Wood KD Assimos DG Holmes RP aelakhna singhakhm 2021 Pettinari JM b k Forty Years of Oxalobacter formigenes a Gutsy Oxalate Degrading Specialist Applied and Environmental Microbiology 87 18 e0054421 Bibcode 2021ApEnM 87E 544D doi 10 1128 AEM 00544 21 PMC 8388816 PMID 34190610 Unden G 2013 Energy Transduction in Anaerobic Bacteria Encyclopedia of Biological Chemistry pp 204 209 doi 10 1016 B978 0 12 378630 2 00282 6 ISBN 978 0 12 378631 9 H A Holt D A Lewis L O White S Y Bastable D S Reeves emsayn 1986 Effect of oral ciprofloxacin on the faecal flora of healthy volunteers European Journal of Clinical Microbiology Springer Nature 5 201 205 1435 4373 Troxel SA Sidhu H Kaul P Low RK emsayn 2003 Intestinal Oxalobacter formigenes colonization in calcium oxalate stone formers and its relation to urinary oxalate Journal of Endourology 17 3 173 176 doi 10 1089 089277903321618743 PMID 12803990 Tunuguntla HS 2001 Can the recurrence of oxalate stones be prevented Role of Oxalobacter formigenes in stone recurrence Journal of Urology 165 S246 Pearle MS Goldfarb DS Assimos DG Curhan G Denu Ciocca CJ Matlaga BR aelakhna singhakhm 2014 Medical management of kidney stones AUA guideline The Journal of Urology 192 2 316 324 doi 10 1016 j juro 2014 05 006 PMID 24857648 S2CID 206623478 Siener R Bangen U Sidhu H Honow R von Unruh G Hesse A mithunayn 2013 The role of Oxalobacter formigenes colonization in calcium oxalate stone disease Kidney International 83 6 1144 1149 doi 10 1038 ki 2013 104 PMID 23536130 Sun NY Gao Y Yu HJ October 2019 Stewart FJ b k Genome Sequence of Oxalobacter formigenes Strain SSYG 15 Microbiology Resource Announcements 8 42 e01059 19 doi 10 1128 MRA 01059 19 PMC 6797538 PMID 31624173 Hatch M Allison MJ Yu F Farmerie W krkdakhm 2017 Genome Sequence of Oxalobacter formigenes Strain OXCC13 Genome Announcements 5 28 e00534 17 doi 10 1128 genomeA 00534 17 PMC 5511905 PMID 28705966 Hatch M Allison MJ Yu F Farmerie W krkdakhm 2017 Genome Sequence of Oxalobacter formigenes Strain HC 1 Genome Announcements 5 27 e00533 17 doi 10 1128 genomeA 00533 17 PMC 5502849 PMID 28684568 Chmiel JA Carr C Stuivenberg GA Venema R Chanyi RM Al KF aelakhna 21 thnwakhm 2022 New perspectives on an old grouping The genomic and phenotypic variability of Oxalobacter formigenes and the implications for calcium oxalate stone prevention Frontiers in Microbiology 13 1011102 doi 10 3389 fmicb 2022 1011102 PMC 9812493 PMID 36620050 Jensen NS Allison MJ 1994 Studies on the diversity among anaerobic oxalate degrading bacteria now in the speciesOxalobacter formigenes abstr I 12 94th General Meeting of the American Society for Microbiology 1994 Washington D C USA American Society for Microbiology p 255 Sidhu H Allison M Peck AB kumphaphnth 1997 Identification and classification of Oxalobacter formigenes strains by using oligonucleotide probes and primers Journal of Clinical Microbiology 35 2 350 353 doi 10 1128 jcm 35 2 350 353 1997 PMC 229578 PMID 9003594 Garrity GM Bell JA Lilburn T 2005 Class II Betaproteobacteria class nov in Brenner DJ Krieg NR Staley JT b k Bergey s Manual of Systematic Bacteriology phasaxngkvs Boston MA Springer US pp 575 922 doi 10 1007 978 0 387 29298 4 2 ISBN 978 0 387 24145 6 subkhnemux 10 phvscikayn 2022 Anantharam V Allison M J Maloney P C 1989 Oxalate formate exchange Journal of Biological Chemistry phasaxngkvs 264 13 7244 7250 doi 10 1016 S0021 9258 18 83227 6 Dawson KA Allison MJ Hartman PA tulakhm 1980 Isolation and some characteristics of anaerobic oxalate degrading bacteria from the rumen Applied and Environmental Microbiology 40 4 833 839 Bibcode 1980ApEnM 40 833D doi 10 1128 aem 40 4 833 839 1980 PMC 291667 PMID 7425628 Kuhner C H Hartman P A Allison M J 1996 Generation of a proton motive force by the anaerobic oxalate degrading bacterium Oxalobacter formigenes Applied and Environmental Microbiology phasaxngkvs 62 7 2494 2500 Bibcode 1996ApEnM 62 2494K doi 10 1128 aem 62 7 2494 2500 1996 ISSN 0099 2240 PMC 168031 PMID 8779588 Cornick N A Allison M J 1996 Assimilation of oxalate acetate and CO 2 by Oxalobacter formigenes Canadian Journal of Microbiology phasaxngkvs 42 11 1081 1086 doi 10 1139 m96 138 ISSN 0008 4166 PMID 8941983 Cornick N A Allison M J 1996 Anabolic Incorporation of Oxalate by Oxalobacter formigenes Applied and Environmental Microbiology phasaxngkvs 62 8 3011 3013 Bibcode 1996ApEnM 62 3011C doi 10 1128 aem 62 8 3011 3013 1996 ISSN 0099 2240 PMC 1388924 PMID 16535386 Duncan SH Richardson AJ Kaul P Holmes RP Allison MJ Stewart CS singhakhm 2002 Oxalobacter formigenes and its potential role in human health Applied and Environmental Microbiology 68 8 3841 3847 Bibcode 2002ApEnM 68 3841D doi 10 1128 AEM 68 8 3841 3847 2002 PMC 124017 PMID 12147479 Lange JN Wood KD Wong H Otto R Mufarrij PW Knight J aelakhna mithunayn 2012 Sensitivity of human strains of Oxalobacter formigenes to commonly prescribed antibiotics Urology 79 6 1286 1289 doi 10 1016 j urology 2011 11 017 PMC 3569510 PMID 22656407 Sidhu H Enatska L Ogden S Williams WN Allison MJ Peck AB mithunayn 1997 Evaluating Children in the Ukraine for Colonization With the Intestinal Bacterium Oxalobacter formigenes Using a Polymerase Chain Reaction based Detection System Molecular Diagnosis 2 2 89 97 doi 10 1016 S1084 8592 97 80015 X PMID 10462596 Kumar R Mukherjee M Bhandari M Kumar A Sidhu H Mittal RD minakhm 2002 Role of Oxalobacter formigenes in calcium oxalate stone disease a study from North India European Urology 41 3 318 322 doi 10 1016 S0302 2838 02 00040 4 PMID 12180235 Kwak C Jeong BC Kim HK Kim EC Chox MS Kim HH phvsphakhm 2003 Molecular epidemiology of fecal Oxalobacter formigenes in healthy adults living in Seoul Korea Journal of Endourology 17 4 239 243 doi 10 1089 089277903765444384 PMID 12816588 Kodama T Mikami K Akakura K Takei K Naya Y Ueda T Ito H krkdakhm 2003 Detection of Oxalobacter formigenes in human feces and study of related genes in a new oxalate degrading bacterium Hinyokika Kiyo Acta Urologica Japonica 49 7 371 376 PMID 12968475 Barnett C Nazzal L Goldfarb DS Blaser MJ kumphaphnth 2016 The Presence of Oxalobacter formigenes in the Microbiome of Healthy Young Adults The Journal of Urology 195 2 499 506 doi 10 1016 j juro 2015 08 070 PMC 4747808 PMID 26292041 Kelly JP Curhan GC Cave DR Anderson TE Kaufman DW emsayn 2011 Factors related to colonization with Oxalobacter formigenes in U S adults Journal of Endourology 25 4 673 679 doi 10 1089 end 2010 0462 PMC 3071521 PMID 21381959 PeBenito A Nazzal L Wang C Li H Jay M Noya Alarcon O aelakhna mkrakhm 2019 Comparative prevalence of Oxalobacter formigenes in three human populations Scientific Reports 9 1 574 Bibcode 2019NatSR 9 574P doi 10 1038 s41598 018 36670 z PMC 6346043 PMID 30679485 Clemente JC Pehrsson EC Blaser MJ Sandhu K Gao Z Wang B aelakhna emsayn 2015 The microbiome of uncontacted Amerindians Science Advances 1 3 Bibcode 2015SciA 1E0183C doi 10 1126 sciadv 1500183 PMC 4517851 PMID 26229982 James LF Cronin EH phvscikayn 1974 Management practices to minimize death losses of sheep grazing Halogeton infested range Journal of Range Management 27 6 424 426 doi 10 2307 3896714 10150 647155 JSTOR 3896714 Cite journal vauthors Allison MJ Littledike ET James LF title Changes in ruminal oxalate degradation rates associated with adaptation to oxalate ingestion journal Journal of Animal Science volume 45 issue 5 pages 1173 1179 date November 1977 pmid 599103 doi 10 2527 jas1977 4551173x df dmy all Daniel SL Cook HM Hartman PA Allison MJ singhakhm 1989 Enumeration of anaerobic oxalate degrading bacteria in the ruminal contents of sheep FEMS Microbiology Letters phasaxngkvs 62 5 329 334 doi 10 1111 j 1574 6968 1989 tb03387 x Federici F Vitali B Gotti R Pasca MR Gobbi S Peck AB Brigidi P knyayn 2004 Characterization and heterologous expression of the oxalyl coenzyme A decarboxylase gene from Bifidobacterium lactis Applied and Environmental Microbiology 70 9 5066 5073 Bibcode 2004ApEnM 70 5066F doi 10 1128 AEM 70 9 5066 5073 2004 PMC 520889 PMID 15345383 Sidhu H Hoppe B Hesse A Tenbrock K Bromme S Rietschel E Peck AB knyayn 1998 Absence of Oxalobacter formigenes in cystic fibrosis patients a risk factor for hyperoxaluria Lancet 352 9133 1026 1029 doi 10 1016 S0140 6736 98 03038 4 PMID 9759746 S2CID 25936201 Mittal RD Kumar R Bid HK Mittal B mkrakhm 2005 Effect of antibiotics on Oxalobacter formigenes colonization of human gastrointestinal tract Journal of Endourology 19 1 102 106 doi 10 1089 end 2005 19 102 PMID 15735393 Kaufman DW Kelly JP Curhan GC Anderson TE Dretler SP Preminger GM Cave DR mithunayn 2008 Oxalobacter formigenes may reduce the risk of calcium oxalate kidney stones Journal of the American Society of Nephrology 19 6 1197 1203 doi 10 1681 ASN 2007101058 PMC 2396938 PMID 18322162 Hoppe B Groothoff JW Hulton SA Cochat P Niaudet P Kemper MJ aelakhna phvscikayn 2011 Efficacy and safety of Oxalobacter formigenes to reduce urinary oxalate in primary hyperoxaluria Nephrology Dialysis Transplantation 26 11 3609 3615 doi 10 1093 ndt gfr107 PMID 21460356 Hoppe B Niaudet P Salomon R Harambat J Hulton SA Van t Hoff W aelakhna phvsphakhm 2017 A randomised Phase I II trial to evaluate the efficacy and safety of orally administered Oxalobacter formigenes to treat primary hyperoxaluria Pediatric Nephrology 32 5 781 790 doi 10 1007 s00467 016 3553 8 PMID 27924398 S2CID 52271121 Milliner D Hoppe B Groothoff J singhakhm 2018 A randomised Phase II III study to evaluate the efficacy and safety of orally administered Oxalobacter formigenes to treat primary hyperoxaluria Urolithiasis 46 4 313 323 doi 10 1007 s00240 017 0998 6 PMC 6061479 PMID 28718073 Tang R Jiang Y Tan A Ye J Xian X Xie Y aelakhna phvscikayn 2018 16S rRNA gene sequencing reveals altered composition of gut microbiota in individuals with kidney stones Urolithiasis 46 6 503 514 doi 10 1007 s00240 018 1037 y PMID 29353409 S2CID 11340007 Ticinesi A Milani C Guerra A Allegri F Lauretani F Nouvenne A aelakhna thnwakhm 2018 Understanding the gut kidney axis in nephrolithiasis an analysis of the gut microbiota composition and functionality of stone formers Gut 67 12 2097 2106 doi 10 1136 gutjnl 2017 315734 PMID 29705728 S2CID 14055215 Ticinesi A Nouvenne A Meschi T krkdakhm 2019 Gut microbiome and kidney stone disease not just an Oxalobacter story Kidney International 96 1 25 27 doi 10 1016 j kint 2019 03 020 PMID 31229040 S2CID 195327195 Miller AW Choy D Penniston KL Lange D krkdakhm 2019 Inhibition of urinary stone disease by a multi species bacterial network ensures healthy oxalate homeostasis Kidney International 96 1 180 188 doi 10 1016 j kint 2019 02 012 PMC 6826259 PMID 31130222 Liu M Koh H Kurtz ZD Battaglia T PeBenito A Li H aelakhna singhakhm 2017 Oxalobacter formigenes associated host features and microbial community structures examined using the American Gut Project Microbiome 5 1 108 doi 10 1186 s40168 017 0316 0 PMC 5571629 PMID 28841836 Arvans D Jung YC Antonopoulos D Koval J Granja I Bashir M aelakhna minakhm 2017 Oxalobacter formigenes Derived Bioactive Factors Stimulate Oxalate Transport by Intestinal Epithelial Cells Journal of the American Society of Nephrology 28 3 876 887 doi 10 1681 ASN 2016020132 PMC 5328155 PMID 27738124 Hatch M Cornelius J Allison M Sidhu H Peck A Freel RW kumphaphnth 2006 Oxalobacter sp reduces urinary oxalate excretion by promoting enteric oxalate secretion Kidney International 69 4 691 698 doi 10 1038 sj ki 5000162 PMID 16518326 Arvans D Chang C Alshaikh A Tesar C Babnigg G Wolfgeher D aelakhna krkdakhm 2023 Sel1 like proteins and peptides are the major Oxalobacter formigenes derived factors stimulating oxalate transport by human intestinal epithelial cells American Journal of Physiology Cell Physiology 325 1 C344 C361 doi 10 1152 ajpcell 00466 2021 PMC 10393326 PMID 37125773