รายชื่อตอนในอีวานเกเลียน มหาสงครามวันพิพากษา

ตอนที่	ชื่อตอน	กำกับภาพ	ออกอากาศครั้งแรก
1	มหันตภัยจากเทวทูต "Angel Attack" (使徒、襲来)	คะซุยะ สึรุมะกิ	4 ตุลาคม 2538
2	นีโอโตเกียวที่ 3 "The Beast" (見知らぬ、天井)	คะซุยะ สึรุมะกิ	11 ตุลาคม 2538
3	อีวานเกเลียน 01 "A Transfer" (鳴らない、電話)	ฮิโระยุกิ อิชิโดะ	18 ตุลาคม 2538
4	การต่อสู้ของชินจิ "Hedgehog's Dilemma" (雨、逃げ出した後)	สึโยะชิ คะงะ	25 ตุลาคม 2538
5	ความลับของเรย์ "Rei I" (レイ、心のむこうに)	เคอิชิ ซุงิยะมะ	1 พฤศจิกายน 2538
6	แผนพิทักษ์นีโอโตเกียวที่ 3 "Rei II" (決戦、第3新東京市)	ฮิโระยุกิ อิชิโดะ	8 พฤศจิกายน 2538
7	ความผิดพลาดของหุ่นรบ เจเอ "A Human Work" (人の造りしもの)	เคอิชิ ซุงิยะมะ	15 พฤศจิกายน 2538
8	อาสึกะมาแล้วจ้า "Asuka Strikes!" (アスカ、来日)	คะซุยะ สึรุมะกิ	22 พฤศจิกายน 2538
9	หัวใจที่เป็นหนึ่งเดียว "Both of You, Dance Like You Want to Win!" (瞬間、心、重ねて)	Seiji Mizushima	29 พฤศจิกายน 2538
10	ผจญภัยใต้ลาวา "Magma Diver" (マグマダイバー)	สึโยะชิ คะงะ ฮิโระยุกิ อิชิโดะ	6 ธันวาคม 2538
11	มฤตยูทมิฬ "The Day Tokyo-3 Stood Still" (静止した闇の中で)	ทะสึยะ วะตะนะเบะ	13 ธันวาคม 2538
12	ปาฏิหาริย์เหนือจีโอฟรอนท์ "She said, 'Don't make others suffer for your personal hatred.'" (奇跡の価値は)	ฮิโระยุกิ อิชิโดะ	20 ธันวาคม 2538
13	เทวทูตบุก "Lilliputian Hitcher" (使徒、侵入)	เท็นไซ โอะกะมุระ	27 ธันวาคม 2538
14	เซเล่ บัลลังก์แห่งวิญญาณ "Weaving a Story" (ゼーレ、魂の座)	มะซะฮิโกะ โอสึกะ	3 มกราคม 2539
15	สายลับจากรัฐบาล "Those women longed for the touch of others' lips, and thus invited their kisses." (嘘と沈黙)	นะโอะยะซุ ฮะบุ	10 มกราคม 2539
16	ย่างก้าวแห่งความตาย "Splitting of the Breast" (死に至る病、そして)	คะซุยะ สึรุมะกิ	17 มกราคม 2539
17	ผู้ถูกเลือกคนที่สี่ "Fourth Children" (四人目の適格者)	Minoru Ohara	24 มกราคม 2539
18	ทางเลือกของชีวิต "Ambivalence" (命の選択を)	เท็นไซ โอะกะมุระ	31 มกราคม 2539
19	การต่อสู้ของลูกผู้ชาย "Introjection" (男の戰い)	มะซะยุกิ	7 กุมภาพันธ์ 2539
20	อีวา มิซาโตะ ชินจิ "WEAVING A STORY 2: oral stage" (心のかたち 人のかたち)	มะซะฮิโกะ โอสึกะ	14 กุมภาพันธ์ 2539
21	กำเนิดองค์การเนิร์ฟ "He was aware that he was still a child." (ネルフ、誕生)	ฮิโระยุกิ อิชิโดะ	21 กุมภาพันธ์ 2539
	หลังจบเพลงปิดของตอน มีการเปิดเผยคลิบวิดีโอลับที่สุดของสหประชาชาติ ถ่ายเมื่อวันที่ 15 สิงหาคม และ 13 กันยายน ค.ศ. 2000 ที่ฐานปฏิบัติการที่ 2 ในทวีปแอนตาร์กติกา
22	อย่างน้อยก็เป็นคน "Don't Be." (せめて、人間らしく)	Akira Takamura คะซุยะ สึรุมะกิ	28 กุมภาพันธ์ 2539
23	น้ำตา "Rei III" (涙)	โชะอิชิ มะซุโอะ (TV) มะซะยุกิ (DC)	6 มีนาคม 2539
24	เทวทูตตนสุดท้าย "The Beginning and the End" (最後のシ者)	โชะอิชิ มะซุโอะ (TV) มะซะยุกิ (DC)	13 มีนาคม 2539
25	จุดจบสิ้น "Do you love me?" (終わる世界)	คะซุยะ สึรุมะกิ	20 มีนาคม 2539
26	ผู้ที่เรียกหาความรัก ""Take care of yourself." (世界の中心でアイを叫んだけもの)	มะซะยุกิ คะซุยะ สึรุมะกิ	27 มีนาคม 2539

ตอนจบฉบับสมบูรณ์

ตอนที่ 25 "จุดจบสิ้น" และ 26 "ผู้ที่เรียกหาความรัก" ในฉบับโทรทัศน์นั้น เป็นตอนจบที่มีเนื้อหารวบรัดมากเกินไป และมีข้อบกพร่องหลายๆอย่าง ทำให้ถือว่าตอนที่ 25 และ 26 ในฉบับโทรทัศน์นั้นเป็น "ตอนจบที่ไม่สมบูรณ์" ทางทีวีโตเกียวจึงร่วมมือกับไกแน็กซ์ ทำตอนจบขึ้นมาใหม่ออกฉายในฉบับภาพยนตร์ นั่นก็คือ อีวานเกเลียน: ปัจฉิมภาค ผู้ชมที่ติดตามทีหลังสามารถข้ามสองตอนนี้ไปชมในฉบับปัจฉิมภาคได้เลย

ตอน	ชื่อตอน	กำกับภาพ	เขียนบท	ฉายครั้งแรก
25'	Ea (Air) In English, (エア)	คะซุยะ สึรุมะกิ	ฮิเดะอะกิ อันโนะ	19 กรกฎาคม 2540
ครึ่งแรกของ อีวานเกเลียน: ปัจฉิมภาค เป็นตอนจบเดียวกับฉบับโทรทัศน์ตอนที่ 25-26
26'	Magokoro o, kimi ni (My Purest Heart for You) In English, (まごころを、君に)	ฮิเดะอะกิ อันโนะ	ฮิเดะอะกิ อันโนะ	19 กรกฎาคม 2540
ครึ่งหลังของ อีวานเกเลียน: ปัจฉิมภาค เป็นตอนจบเดียวกับฉบับโทรทัศน์ในตอนที่ 25-26

1. Also known alternately as "My Pure Heart for You", or with the additional bracketed title, "My Purest Heart for You (Sincerely Yours)". The English title is also known simply as "I need you."